目前腸病毒中，除了小兒麻痺病毒以外，沒有疫苗可以預防，所以勤於正確洗手、保持良好個人衛生習慣，減少被傳染的機會是預防的基本方法。
(一)正確的洗手方法如下：
1.在水龍頭下把手淋濕
2.擦上肥皂或洗手液
3.兩手心互相磨擦
4.兩手揉搓自手背至手指
5.兩手揉搓手掌及手背
6.作拉手姿勢以擦洗指尖
7.用清水將雙手洗淨，關水前先捧水將水龍頭沖洗乾淨
8.用乾淨的紙巾或烘手機將手烘乾
(二)流行期間儘量避免出入公共場所，不要跟疑似病患(家人或同學)接觸。
(三)注意環境衛生及通風。
(四)罹病之學童，宜請假暫勿上課，接受治療並好好休息，同時也可避免傳染其他學童。
(五)增強個人之免疫力，請注意營養、均衡飲食及運動。
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